Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA4CQ9C0C4 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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