Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms