Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CTXN3Q4LDR2 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CTXN3Q4LDR2 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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