Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CCDC142Q17RM4 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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