Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 IGHV1-24-201ENST00000390610 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC002367.1-201ENST00000416765 405 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 BICRA-AS1-201ENST00000598376 547 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PGAM1P5-203ENST00000626376 313 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC02034-201ENST00000635368 760 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC091885.2-201ENST00000510391 1791 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
VAMP3Q15836 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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