Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
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