Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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CUL3Q13618 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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CUL3Q13618 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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CUL3Q13618 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CUL3Q13618 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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