Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms