Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
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TCOF1Q13428 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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TCOF1Q13428 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC8.19□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
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TCOF1Q13428 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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TCOF1Q13428 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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TCOF1Q13428 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
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TCOF1Q13428 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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