Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRIM28Q13263 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
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