Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 PHLPP2-206ENST00000568954 8317 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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CENPFP49454 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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CENPFP49454 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CENPFP49454 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CENPFP49454 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CENPFP49454 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CENPFP49454 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPFP49454 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPFP49454 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPFP49454 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPFP49454 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPFP49454 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPFP49454 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPFP49454 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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