Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
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PTPRMP28827 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PTPRMP28827 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PTPRMP28827 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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