Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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FOXQ1Q9C009 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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FOXQ1Q9C009 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
FOXQ1Q9C009 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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