Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ARNT-208ENST00000505755 2427 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL19-202ENST00000393909 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ATL1-202ENST00000441560 2853 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AP005264.8-201ENST00000623093 3313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP194-201ENST00000411328 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV22-1-201ENST00000424543 337 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-DRB6-203ENST00000437650 715 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108488.1-205ENST00000438482 914 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 Z69666.1-201ENST00000445733 801 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008915.1-201ENST00000561624 837 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL669831.6-201ENST00000635557 837 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GJC1-201ENST00000330514 3295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4458HG-203ENST00000606459 3239 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DIS3-205ENST00000545453 3651 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZWILCH-214ENST00000613446 3181 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CALML4-208ENST00000540479 4603 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms