Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.6 ms