Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RAD18-201ENST00000264926 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LTBP4Q8N2S1 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms