Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IMPG1Q17R60 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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