Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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