Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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