Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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PTCH1Q13635 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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PTCH1Q13635 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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PTCH1Q13635 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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