Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 BSNDP3-201ENST00000617487 364 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC247036.7-201ENST00000639643 304 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 HM13-224ENST00000498035 3932 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CD300LD-201ENST00000375352 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SEZ6L-204ENST00000402979 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 BMS1P1-202ENST00000580094 4294 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ZNF714-201ENST00000425625 2562 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RASSF6-201ENST00000307439 5994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CTAGE5-205ENST00000348007 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 PTPN20-205ENST00000395721 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 FAM193A-210ENST00000545951 3987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ABCC2-201ENST00000370434 1714 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TAOK3-209ENST00000537952 2147 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 DDHD1-203ENST00000395606 12769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ZNF583-202ENST00000333201 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 DIAPH3-202ENST00000377908 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 OTOA-204ENST00000388958 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC064862.3-201ENST00000411435 571 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 LINC01865-201ENST00000430529 845 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RPL21P88-201ENST00000436649 436 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MIATNB-204ENST00000437071 1006 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ARAFP3-201ENST00000454154 490 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 LINC01944-201ENST00000517916 416 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC103409.1-202ENST00000518416 577 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P38-201ENST00000523612 957 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC126323.1-201ENST00000561706 611 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 EIF5AP3-201ENST00000589460 462 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC012100.3-201ENST00000624738 575 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AKAP2-202ENST00000374525 6866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 UGT2B7-203ENST00000508661 1633 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 LRRC37A4P-202ENST00000581296 5372 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ZNF565-203ENST00000392173 1931 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CA5B-204ENST00000454127 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ZSCAN23-201ENST00000289788 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MYEF2-202ENST00000324324 10360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ALDH1L2-201ENST00000258494 7547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CCDC113-201ENST00000219299 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TMEM108-211ENST00000515826 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CELF2-215ENST00000636488 3908 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 GJA5-202ENST00000579774 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ANKS1B-213ENST00000549025 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 DMBT1-202ENST00000338354 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 DMBT1-203ENST00000344338 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 DMBT1-204ENST00000368909 7686 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 DMBT1-207ENST00000619379 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC020951.1-201ENST00000624361 2271 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CSNK1G1-211ENST00000635142 5548 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 UGT2B4-206ENST00000512583 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TTLL5-201ENST00000286650 1595 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 IFT43-201ENST00000238628 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL590730.1-202ENST00000418875 321 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC244102.1-201ENST00000437309 848 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ASS1P4-201ENST00000439462 1234 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms