Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
TCOF1Q13428 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
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TCOF1Q13428 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
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TCOF1Q13428 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
TCOF1Q13428 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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