Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ITGB3BPQ13352 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ITGB3BPQ13352 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms