Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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