Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms