Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTP4A2Q12974 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PTP4A2Q12974 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTP4A2Q12974 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTP4A2Q12974 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTP4A2Q12974 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTP4A2Q12974 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTP4A2Q12974 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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