Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
EFEMP1Q12805 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms