Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms