Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FAM3AP98173 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms