Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TTPAP49638 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TTPAP49638 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TTPAP49638 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms