Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COPS7AQ9UBW8 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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