Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
EHD3Q9NZN3 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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