Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 CLEC19A-205ENST00000636231 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC01924-201ENST00000589376 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL137145.2-201ENST00000399868 3086 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC01695-203ENST00000453420 4486 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SLC15A1-202ENST00000376503 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC008498.2-201ENST00000624033 2322 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RNU1-11P-201ENST00000383975 164 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC009269.1-202ENST00000484381 469 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 ADAM2-205ENST00000521880 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 RAD51B-211ENST00000487861 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LINC01182-202ENST00000510907 2228 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 PRCP-202ENST00000393399 2120 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 LL22NC03-63E9.3-201ENST00000407120 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BCL11BQ9C0K0 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms