Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CCDC93Q567U6 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CCDC93Q567U6 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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