Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USF2Q15853 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USF2Q15853 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
USF2Q15853 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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