Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL1Q13616 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms