Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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NEUROD1Q13562 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NEUROD1Q13562 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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