Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CHAF1AQ13111 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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