Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CARF-201ENST00000320443 5209 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CEP68-205ENST00000537589 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 NVL-203ENST00000391875 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SLC5A1-201ENST00000266088 5061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ZSCAN9-207ENST00000531979 1601 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL137782.1-201ENST00000563635 4128 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SAMD8-201ENST00000372687 6935 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AURKA-204ENST00000395907 1902 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MAPK10-312ENST00000641391 2488 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MAPK10-378ENST00000642009 2463 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 FGA-202ENST00000403106 2248 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CD22-201ENST00000085219 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ZNF468-201ENST00000243639 4027 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 BRPF1-206ENST00000457855 4308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL078621.1-201ENST00000272567 768 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC005863.1-201ENST00000379640 2998 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 TTC23-203ENST00000394132 3849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC008619.1-201ENST00000524312 567 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC093484.4-201ENST00000583934 461 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RN7SL82P-201ENST00000611435 237 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RN7SL628P-201ENST00000619139 237 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ANAPC1-210ENST00000628342 450 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ZFP2-205ENST00000523286 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 TRIM55-204ENST00000353317 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PHLDB2-207ENST00000477695 5813 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 DPH3-202ENST00000383775 3052 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ERMAP-203ENST00000372517 3423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC114324.1-201ENST00000504077 3152 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 DNAI1-201ENST00000242317 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MYH2-204ENST00000532183 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ATP5A1P3-201ENST00000573189 1507 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 GLDCP1-201ENST00000510885 2678 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 FANK1-201ENST00000368689 522 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL773572.1-202ENST00000440221 1004 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
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