Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXF2Q12947 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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