Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL513548.2-201ENST00000602994 1207 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPN13Q12923 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms