Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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