Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms