Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC008938.1-201ENST00000566929 6510 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CENPFP49454 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZBTB40-202ENST00000375647 8685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CENPFP49454 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 NCKAP5-201ENST00000317721 7593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 NCKAP5-205ENST00000409261 7594 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ERG-203ENST00000398905 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ERG-204ENST00000398907 4809 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CENPFP49454 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms