Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 OPALIN-206ENST00000611913 3115 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 LINC01132-201ENST00000437601 3793 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPREP23469 CD36-214ENST00000447544 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SLC2A11-205ENST00000403208 564 ntTSL 4 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC091182.2-201ENST00000520431 578 ntTSL 4 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 VPS13D-212ENST00000543766 3838 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 LINC02289-202ENST00000556781 861 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 OR7E11P-202ENST00000642027 1491 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 CAGE1-208ENST00000512086 2537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 IL22RA2-201ENST00000296980 2886 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 PIBF1-208ENST00000617689 2882 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 MKL2-205ENST00000572567 2185 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 GIP-201ENST00000357424 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPREP23469 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
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