Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRCP08575 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRCP08575 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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