Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
LRRIQ1Q96JM4 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms