Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

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Length 828 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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COG3Q96JB2 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
COG3Q96JB2 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
COG3Q96JB2 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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