Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CSNK1A1-206ENST00000515748 620 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP003385.2-201ENST00000524910 973 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP000879.2-201ENST00000530525 497 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TBX5-AS1-203ENST00000531202 822 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC005842.1-201ENST00000537149 678 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC138123.2-204ENST00000547432 721 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC025575.2-201ENST00000549357 565 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR11K1P-201ENST00000558299 904 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC092142.1-202ENST00000567021 829 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CDRT7-201ENST00000568256 767 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC018521.4-201ENST00000578239 531 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RN7SL198P-201ENST00000583190 258 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC024592.2-201ENST00000589276 1188 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC015911.8-201ENST00000592517 560 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC020908.2-201ENST00000595134 405 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 C1orf186-208ENST00000603378 614 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MIR6081-201ENST00000613785 97 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NUDT13-208ENST00000617744 928 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC074029.3-201ENST00000618623 312 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ANXA2-204ENST00000451270 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AIG1-202ENST00000357847 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC019077.1-201ENST00000356499 397 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GHRH-203ENST00000373614 570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL513302.1-201ENST00000415679 428 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL36A-203ENST00000427805 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MIR646HG-206ENST00000431181 858 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ADGRF5P1-201ENST00000435875 1135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PNLIPP1-201ENST00000439233 675 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.4 ms