Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MYO9A-201ENST00000356056 12411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF765-206ENST00000594030 7588 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms